Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP1Q9GZU7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms