Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM39BQ9GZU3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39BQ9GZU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39BQ9GZU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms