Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP44Q9C0F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms