Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZC3H12CQ9C0D7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZC3H12CQ9C0D7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZC3H12CQ9C0D7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms