Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZNF518BQ9C0D4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF518BQ9C0D4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms