Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC2Q9C0B9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms