Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM5Q9C035 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM5Q9C035 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms