Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IFIH1Q9BYX4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFIH1Q9BYX4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFIH1Q9BYX4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms