Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM55Q9BYV6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM55Q9BYV6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms