Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPO3Q9BXY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms