Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP3Q9BWW4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms