Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTKNQ9BST9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms