Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2Q9BSQ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCM2Q9BSQ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms