Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TIMM29Q9BSF4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM29Q9BSF4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms