Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms