Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPIN3Q9BQK8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPIN3Q9BQK8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms