Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF25Q9BQ70 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF25Q9BQ70 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF25Q9BQ70 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms