Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VGLL1Q99990 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms