Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CITED1Q99966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED1Q99966 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms