Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3AQ99856 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARID3AQ99856 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms