Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms