Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGRRF1Q99675 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGRRF1Q99675 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGRRF1Q99675 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms