Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF4Q99607 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ELF4Q99607 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ELF4Q99607 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELF4Q99607 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELF4Q99607 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ELF4Q99607 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF4Q99607 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ELF4Q99607 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF4Q99607 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF4Q99607 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF4Q99607 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ELF4Q99607 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms