Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms