Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LGMNQ99538 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LGMNQ99538 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms