Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCF12Q99081 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms