Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSRNP1Q96S65 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms