Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED4Q96RK1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED4Q96RK1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms