Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC4A9Q96Q91 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A9Q96Q91 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A9Q96Q91 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms