Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP3Q96P20 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NLRP3Q96P20 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms