Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
JSRP1Q96MG2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
JSRP1Q96MG2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms