Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALPK3Q96L96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms