Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD4Q96KN9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJD4Q96KN9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJD4Q96KN9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms