Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSLNLQ96KJ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSLNLQ96KJ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms