Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCORQ96JN0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms