Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCPIP1Q96JH7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms