Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCMH1Q96GD3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms