Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEIL1Q96FI4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms