Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EDC3Q96F86 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms