Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHFRQ96EP1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHFRQ96EP1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHFRQ96EP1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms