Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms