Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPDL1Q96EA4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPDL1Q96EA4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms