Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CMTM5Q96DZ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms