Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHDC3Q96DC8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECHDC3Q96DC8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECHDC3Q96DC8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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