Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms