Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1AQ96AJ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms