Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1E2Q96A05 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms