Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms