Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHMTQ93088 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms