Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP13Q92995 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP13Q92995 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP13Q92995 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP13Q92995 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP13Q92995 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms